A Dunai Krokodilok története egészen a '90-es évek végéig nyúlik vissza. Ekkor ismerkedett meg a floorballal Veisz László, a klub egyik alapító tagja, jelenlegi elnöke. László néhány finn munkatárssal az oldalán kezdett játszani, majd szépen lassan egyre több magyar is csatlakozott a csapathoz, mígnem elkerülhetetlenné vált az a lépés, hogy hivatalosan is megalakuljon a klub, és elindulhasson a nemzeti bajnokságokban. 2000-et írunk, amikor az utolsó bírósági pecsét is rákerül az alapító okiratra.
Habár mindig a meghatározó csapatok közé tartozott a Dunai Krokodilok SE a hazai férfi mezőny elitjében (OBI), csak az utóbbi években sikerült kiugró teljesítményt elérni: a sportágtörténelmi 2004/2005-ös bajnoki cím megszerzése után 2005/06-ban a címvédés is sikerült. Sőt, ebben az évben a Krokodilok U13-as csapata is megnyerte a korosztályos országos bajnokságot. A sikerszéria 2009-ben is folytatódott, a Fiú U17-es bajnoki cím mellett 4 ezüstöt (OBI, Férfi MK, Fiú U15 és Fiú U17) szereztek csapataink.
A 2009/10-es szezonban aztán végül ismét sikerült OBI-es csapatunknak az első helyen végeznie, miközben a kupasorozatban ismét a második helyet szerezték meg.

A 2010/11-es évadban a 2006-os év után ismét bajnoki címvédés történt. Rendkívül kiélezett kűzdelem során egy utolsó pillanatokban szerzett találattal szereztük meg a győzelmet a legfőbb riválisunk ellen hazai pályán, amivel bebiztosítottuk a 4. bajnoki címünket. A Magyar Kupában ebben a szezonban is csak a döntőig jutottunk, így sorozatban a 3. kupa ezüstöt is begyűjtöttük.

 

 

2011/12-ben a csapat történetében először védtük meg kétszer egymás után a bajnoki címünket, így már az 5. aranyérmet szerezve ezzel egyesületünknek. A sikerhez párosult egy OBIII-as győzelem is, ugyanis frissen alakult 3. vonal beli gárdánk megnyerte a bajnokságot (a csapat úgy döntött, hogy nem száll ringbe a 2.vonalban, így a 2013-ban ismét az OBIII-ban szerepelnek). Ez mellé U14-es fiataljaink letettek még egy aranyérmet az asztalra és egy ezüstérmet szállított az U16-os csapat is.

A 2012/13-as szezonban hat sorozatban versenyeztek csapataink: OBI, OBIII, Férfi MK (OBI-es és OBIII-as csapat is), Fiú U19, Fiú U16, Fiú U14. Az utánpótlás csapatok felkészítését Szabó Gábor testnevelő és Mile Lajos vezette. Az OBI-es csapat bronzérmet szerzett a bajnokságban és egy újabb ezüst érmet a Magyar Kupában, míg utánpótlásban egy újabb bajnoki cím (U16) és egy ezüstérem (U19) volt a termés. Továbbá a legkisebbek az unihoki bajnokságokban is kipróbálhatták magukat.

A 2013/14-es szezonban a jelentősen átalakult és megfiatalodott OB1-es csapat akár a végső győzelemre is esélyes lehet minden sorozatban, csakúgy, mint U19-es és U16-os csapataink, valamint unihoki U11 és U13 alakulataink.